Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms