Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms