Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc3Q91W40 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms