Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms