Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms