Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VDP2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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