Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Fam20bQ8VCS3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Fam20bQ8VCS3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Fam20bQ8VCS3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Fam20bQ8VCS3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Fam20bQ8VCS3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Fam20bQ8VCS3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Fam20bQ8VCS3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Fam20bQ8VCS3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Fam20bQ8VCS3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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