Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sgms1Q8VCQ6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgms1Q8VCQ6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sgms1Q8VCQ6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgms1Q8VCQ6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgms1Q8VCQ6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms1Q8VCQ6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms1Q8VCQ6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms1Q8VCQ6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms1Q8VCQ6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms1Q8VCQ6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms1Q8VCQ6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms1Q8VCQ6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms1Q8VCQ6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms1Q8VCQ6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms1Q8VCQ6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sgms1Q8VCQ6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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