Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssx2ipQ8VC66 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssx2ipQ8VC66 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssx2ipQ8VC66 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssx2ipQ8VC66 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssx2ipQ8VC66 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssx2ipQ8VC66 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssx2ipQ8VC66 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssx2ipQ8VC66 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssx2ipQ8VC66 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssx2ipQ8VC66 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssx2ipQ8VC66 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssx2ipQ8VC66 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ssx2ipQ8VC66 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssx2ipQ8VC66 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms