Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ccdc58Q8R3Q6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ccdc58Q8R3Q6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ccdc58Q8R3Q6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ccdc58Q8R3Q6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ccdc58Q8R3Q6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ccdc58Q8R3Q6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ccdc58Q8R3Q6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ccdc58Q8R3Q6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Ccdc58Q8R3Q6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc58Q8R3Q6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ccdc58Q8R3Q6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms