Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc12Q8R344 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms