Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Impg1Q8R1W8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Impg1Q8R1W8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Impg1Q8R1W8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Impg1Q8R1W8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Impg1Q8R1W8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Impg1Q8R1W8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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