Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcsapQ8QZT2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcsapQ8QZT2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcsapQ8QZT2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcsapQ8QZT2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcsapQ8QZT2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcsapQ8QZT2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcsapQ8QZT2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CcsapQ8QZT2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcsapQ8QZT2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcsapQ8QZT2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcsapQ8QZT2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcsapQ8QZT2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcsapQ8QZT2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcsapQ8QZT2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms