Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Hecw1Q8K4P8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hecw1Q8K4P8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms