Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OptnQ8K3K8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms