Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms