Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms