Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms