Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms