Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sde2Q8K1J5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms