Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LgsnQ8CIX8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms