Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ercc8Q8CFD5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ercc8Q8CFD5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ercc8Q8CFD5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ercc8Q8CFD5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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