Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Klhl11Q8CE33 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl11Q8CE33 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms