Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms