Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam228aQ8CDW1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms