Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms