Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb1Q8CBF3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms