Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfibp1Q8C8U0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppfibp1Q8C8U0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms