Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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