Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ubqln3Q8C5U9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ubqln3Q8C5U9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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