Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Atg16l1Q8C0J2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Atg16l1Q8C0J2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Atg16l1Q8C0J2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Atg16l1Q8C0J2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Atg16l1Q8C0J2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Atg16l1Q8C0J2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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