Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms