Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Cldn17Q8BXA6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Cldn17Q8BXA6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Cldn17Q8BXA6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Cldn17Q8BXA6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Cldn17Q8BXA6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Cldn17Q8BXA6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Cldn17Q8BXA6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Cldn17Q8BXA6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Cldn17Q8BXA6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Cldn17Q8BXA6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Cldn17Q8BXA6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Cldn17Q8BXA6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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