Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad3Q8BUN5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms