Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms