Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms