Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc2Q8BKV1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms