Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan9Q8BJU2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms