Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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