Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE4

Susd6, Sushi domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd6Q8BGE4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms