Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf187Q8BFX1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf187Q8BFX1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf187Q8BFX1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf187Q8BFX1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf187Q8BFX1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf187Q8BFX1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf187Q8BFX1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf187Q8BFX1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms