Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cpped1Q8BFS6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cpped1Q8BFS6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cpped1Q8BFS6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpped1Q8BFS6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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