Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms