Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms