Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem39bQ810L4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem39bQ810L4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem39bQ810L4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem39bQ810L4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem39bQ810L4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem39bQ810L4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem39bQ810L4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem39bQ810L4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem39bQ810L4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem39bQ810L4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem39bQ810L4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem39bQ810L4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem39bQ810L4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem39bQ810L4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem39bQ810L4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem39bQ810L4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem39bQ810L4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms