Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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