Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk9Q80W65 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms