Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms