Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms