Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms